Do ảnh hưởng của dịch bệnh Covid-19 khiến lượng hành khách đi tàu sụt giảm nên từ 14-8-2020 Công ty Vận tải đường sắt Sài Gòn thông báo sẽ tạm dừng chạy đôi tàu SE3/SE4 (Hà Nội - TP Hồ Chí Minh và ngược lại)
Hành khách có vé đi tàu SE3/SE4 những ngày tàu dừng có thể liên hệ nhà ga để trả lại vé không mất phí.
Như vậy, kể từ ngày 14-8 trên tuyến đường sắt Thống Nhất chỉ còn duy trì ba đôi tàu khách chạy hằng ngày là: SE1/SE2; SE5/SE6; SE7/SE8.
Các công ty vận tải đường sắt khuyến cáo hành khách khi đi tàu cần lưu ý: khai báo y tế trước khi lên tàu; kiểm tra thân nhiệt tại các nhà ga; thường xuyên rửa tay bằng dung dịch hoặc xà phòng sát khuẩn (được trang bị tại nhà ga và trên tàu,...); đeo khẩu trang tại các nhà ga và trên tàu; hạn chế đi lại giữa các toa xe nếu không thực sự cần thiết.